Uploaden DNA

  • Roy Weynschenk
  • Roy Weynschenk's Profielfoto Onderwerp Auteur
  • Offline
Meer
06 dec 2017 08:32 #1942 door Roy Weynschenk
Roy Weynschenk heeft een nieuw onderwerp gemaakt: Uploaden DNA
Ik heb mijn DNA al laten bepalen. Kan ik dit ook uploaden naar IGV en zo ja wat gebeurt er dan mee?

Gelieve Inloggen om te deelnemen aan het gesprek.

Meer
06 dec 2017 11:07 #1943 door H.J. Verbaarschott
H.J. Verbaarschott antwoordt op het onderwerp: Uploaden DNA
Misschien dat er een Indisch-Nederlandse databank voor dna gemaakt kan worden.
Met als doel door vergelijkingen verwantschappen aan te tonen.
Nazaten van Indische families leggen hun dna-profiel bij de bank.
En computerprogramma's zoeken naar herkomst regio, neven en nichten, oudooms en oudtantes.
Kan dit ?
Zijn er nadelen bijv privacy.
Ik weet niks van mogelijkheden met dna-onderzoek, dus

Gelieve Inloggen om te deelnemen aan het gesprek.

Meer
07 dec 2017 14:15 #1944 door M. Fornerod
M. Fornerod antwoordt op het onderwerp: Uploaden DNA
Nee, je kan het niet uploaden naar de IGV site, maar er is wel een andere site, gedmatch.com, waar je je data kan uploaden en beschikbaar maken voor anderen, zonder je ruwe data prijs te geven (vanwege privacyredenen). Gedmatch.com is een gratis maar professioneel project, en ik stel voor dat iedereen die Indisch DNA laat bepalen hun data daar upload.
De gedmatch site lijkt wat intimiderend voor de beginner, maar als je alles rustig leest kom je er wel uit.
Wat je moet doen is het volgende:
1. Download je ruwe gegevens vanuit Ancestry of 23andme of familytreedna naar je computer. Dit gebeurd als zip file. Laat de file in het zip formaat (!!). Dus niet unzippen.
2. Registreer je bij gedmatch.com (Click HERE to register)
3. Upload je zipfile naar gedmatch.com (Raw DNA file Uploads, volg de instructies)
4. Aan de rechterkant van het gedmatch hoofdscherm komt als het goed is de status van je uploads (Your DNA Resources)
5. Wacht een paar uur tot een dag. Je DNA wordt in die tijd vergeleken met de hele database. De status kan je volgen.
6. Daarna kan je analyses beginnen te doen, te beginnen met "One-to-Many' (vergelijk jezelf met de database) of voor de grap: predict eye color. Klopt vaak nog ook!
Neem de tijd om alles te lezen wat op de website staat. Probeer dingen uit. Vraag het op het forum!

Gelieve Inloggen om te deelnemen aan het gesprek.

Meer
16 dec 2017 21:07 #1961 door Tj. Schillhorn van Veen
Tj. Schillhorn van Veen antwoordt op het onderwerp: Uploaden DNA en risico's
Alle waardering voor het DNA initiatief en het enthousiasme van Maarten Formerod maar ik mis een aantal waarschuwingen. Het valt mij op (via DuckDuckGo) dat er in Nederland niet zo veel aandacht aan de risico’s wordt besteedt (zie voor Engels-taaligen bv Wirecutter van 30/8/2017).
1. Privacy. Wat gebeurd er met de analyse resultaten en wat gebeurd er met het test materiaal? Het is bekend dat een aantal van de maatschappijen die deze testen aanbieden de resultaten ook verkopen aan de farmaceutische industrie en misschien zelfs aan verzekerings maatschappijen en anderen; de anonimiteit die ze de klanten verzekeren varieert (maar wat is anoniem in de huidige tech wereld?). Ook de politie heeft toegang tot de resultaten en tot het eventueel opgeslagen test materiaal.
Het verdient aanbeveling om de foldertjes heel goed te lezen of zelfs direct de test maatschappij te vragen over deze zaken: sommige maatschappijen zijn bereid om het test materiaal niet op te slaan en/of, op verzoek, de resultaten niet verder te gebruiken of uit te wissen.
2. De kwaliteit van de testen en maatschappijen varieerd. Dit compliceert onder vergelijkingen van resultaten (in Amerika hebben deze maatschappijen een qualiteits fiat nodig van de Food & Drug Adminstration).
3. Er zijn nog geen testen op de markt die specifiek zijn voor Aziatische genealogie (wel voor Afrikaanse bv “AfricanAncestry”) dus de resultaten zijn vrij globaal; maar uiteraard vaak leuk voor de familie etc.

Een database binnen de IGV is dan wel aardig, maar het lijkt me moeilijk om de privacy te waarborgen (“hackproof” te maken). Participanten moeten wel geïnformeerd worden over het risico dat hun gegevens niet meer volledig privé zijn. Ik neem ook aan dat er een soort aansprakelijkheid's risico is voor de IGV als de data niet heel goed versleuteld zijn.

Tjaart

Gelieve Inloggen om te deelnemen aan het gesprek.

Meer
21 dec 2017 06:15 - 21 dec 2017 06:21 #1971 door M. Fornerod
M. Fornerod antwoordt op het onderwerp: Uploaden DNA en risico's
Beste Tjaart,

1. Privacy is inderdaad een belangrijk punt en we gaan daar binnenkort ook aandacht aan besteden. De "grote drie" (Ancestry, FamilytreeDNA en 23andme) hebben hier zeer stricte richtlijnen voor, zie daarvoor hun websites. Bovendien is bij elk van de drie precies aan te geven hoeveel informatie je wilt delen met anderen. Individuele ruwe DNA gegevens worden niet gedeeld tenzij je hier expliciet toestemming voor geeft. Overigens ben je niet verplicht je werkelijke naam te gebruiken bij het laten bepalen van je DNA, reden waarom verzekeringsmaatschappijen waarschijnlijk niet erg happig zullen zijn op deze data, als ze er al aan zouden kunnen komen. Wat wel zo is dat (Amerikaanse) opsporingsdiensten onder bepaalde voorwaarden toegang zullen kunnen eisen, en wellicht zijn geheime diensten ook erg geinteresseerd. Ook is het zo dat de DNA tests maar en klein gedeelte van je DNA variatie bepalen, 5-10%. Dit is genoeg om familieverbanden te ontrafelen, maar niet om alles te weten over bijvoorbeeld iemands gezondheid.
2. Wat kwaliteit betreft, de grote drie zijn in de USA gebaseerd, dus zouden een FDA goedkeuring hebben. Ik heb overigens mijn eigen autosomaal DNA bij zowel Ancestry en FTDNA leten testen, en de overeenkomst was >99%.
3. Een eigen DNA database aanleggen bij IGV lijkt me niet aan de orde. Dit is wat bijvoorbeeld privacy betreft helemaal buiten ons straatje.

Hartelijke groet,

Maarten
Laatst bewerkt: 21 dec 2017 06:21 door M. Fornerod.

Gelieve Inloggen om te deelnemen aan het gesprek.

Gemaakt door Kunena